CUT&RUN 提供了一种检测细胞中蛋白-DNA 相互作用的快速、可靠且真正的低细胞数测定法. 与 ChIP 实验不同，CUT&RUN 不存在甲醛交联、染色质碎裂和免疫沉淀，使之成为一种使蛋白-DNA 相互作用富集和检测靶基因的更快且更有效的方法. CUT&RUN 可在一天之内完成从活细胞到纯化 DNA 的过程，且经证明每次检测只需使用少至 500-1000 个细胞. 和 ChIP 中碎裂所有细胞染色质不同，CUT&RUN 利用一种染色质抗体靶向消化方法，从而使背景信号比 ChIP 实验低得多. 9/10.
