10　南燕主慕容备德听闻桓玄兵败，命北地王慕容钟等将兵，准备夺取江南，不巧慕容备德生病，于是停止。
11　夏，四月二日，武陵王司马遵入居东宫，接受朝廷内外的最高礼敬；任免百官的命令称为“制书”，政令称“令书”。任命司马休之为监荆州、益州、梁州、宁州、秦州、雍州六州诸军事，兼领荆州刺史。
四月三日，桓玄挟持皇帝司马德宗到了江陵，桓石康迎接。桓玄重新署置百官，任命卞范之为尚书仆射。桓玄自以为奔败之后，担心威令不行，于是更加严刑峻法，众人则越发离心怨恨。殷仲文进谏，桓玄怒道：“如今因为诸将不听指挥，加之天象不利，所以回到楚国旧都；而群小纷纷，妄议朝政！正当纠之以猛，不可施之以宽。”荆州、江州诸郡听闻桓玄西撤，有上表来问候起居的，桓玄一概不接受，下令他们重新上表祝贺喜迁新都。
当初，王谧是桓玄的开国元勋，桓玄受禅，是王谧亲手解下皇帝司马德宗的玺绶。等到桓玄失败，众人都说王谧应该诛杀，刘裕特别保全他。刘毅曾经在朝会的时候，问王谧皇帝玺绶在哪里。王谧心中不能自安，逃奔曲阿。刘裕写信给武陵王司马遵，迎接王谧回来，官复原位。